A MANNA rendszer moduláris felépítésű integrált rendszer. A rendszer által támogatott fő nyilvántartási folyamatban résztvevő adatkörök idősoros, állapot kezelt nyilvántartási rendben kerülnek rögzítésre.
Az egyes modulok közötti kapcsolatok állapot vezéreltek, valamint egyértelmű adat interfésszel rendelkeznek. Ennek folytán a rendszer, a támogatott üzleti folyamat főbb nyilvántartási pontjain tetszőleges nyilvántartási rendszerbe képes az ott kezelt adatokat átadni illetve onnan átvenni.
Ezt kihasználva, a nyilvántartási rendszer gerincét képező folyamathoz egyéb (a pénzügyi nyilvántartástól eltérő) szakmai funkciókat megvalósító rendszerek, vagy modulok kapcsolódhatnak.